目录(Category)栏，为适应用户习惯，又名文件夹栏，在WizExplorer主窗口左侧栏。主要功能是用户在此可自行组织文档的层次目录结构，以分类的方式进行知识管理。
常见界面如下：
在目录栏中，以树视图的形式显示用户目录结构。
鼠标点击每个文件夹后，将在文档列表中显示这个文件夹下所有的文档。
主要分为根文件夹（根目录）和文件夹（目录）两种类型。主要区别为：根文件夹没有上级文件夹，文件夹为上级文件夹的子文文件夹。
根文件夹可以设置为同步和离线两种：
因为功能设计，系统默认命名了一些文件夹名，注意不要新建重名文件夹。
这些文件夹是：
当文档删除后，都会放入这个回收站，只有点击清空回收站，才会彻底删除，此目录为离线目录
当新建文档没有指定目录时候，会自动保存在这个草稿目录中
日记功能保存的目录，以年月的方式存放（如2004-04）
便笺和任务列表文档保存的目录，以年月的方式存放（如2004-04）
日历功能保存事件文档的目录，以年月的方式存放（如2004-04）
联系人功能保存联系人文档的目录
手机终端新建的文档保存的目录，以年月的方式存放（如2004-04）在根文件夹后，有灰色的数字显示此文件夹下文档的数量。
如果此文件夹还有子文件夹，则显示两个数目，以斜杠“/”分隔，第一个数目表示此文件夹下的文档数(不包含子文件夹)，第二个数目表示此文件夹下所有文档数（包含子文件夹）。
如果此文件夹没有子文件夹，则只显示一个数目，表示当前文件夹下的文档数。
目录的上面为动态文件夹区，以蓝色横线分隔，如图
主要是一些虚拟的文件夹，方便快速查看一些符合条件的文档。
目前只有一项，为：最近保存，点击后将可以看到按保存时间排序的近日最后保存文件列表。
对于文件夹的操作，主要是使用鼠标右键菜单来操作
在普通文件夹上点击右键，即可出现下图菜单
图 文件夹右键菜单
选择此项，将会在所选目录下用WizHtmlEditor新建一个文档。
在“我的联系人”和“我的日记”目录上右键菜单显示的是“新建联系人”和“新建日记”。
选择此项，将会调用Windows资源管理器，并显示到当前文件夹的物理目录。
选择此项，将会刷新目录树。
快捷键是F5
选择此项，将会弹出移动文件夹窗口，可将选中目录移动到其他目录下。
图 移动文件夹对话框
在此对话框中，选择目标文件夹，点击确定按钮，即可将选择目录移动为目标目录的子目录。
选择此项，将直接把文件夹移动到根目录，类型自动变为根文件夹。
选择此项，将整个文件夹及文件夹下的所有子文件夹、文档全部移动到“已删除”中。通过清空“已删除”即可彻底删除。
快捷方式为Del
选择此项，将弹出重命名对话框，可以修改文件夹名称。
图 文件夹重命名窗口
选择此项，将在此文件夹下新建一个子文件夹，需输入子文件夹名。
图 创建新文件夹窗口
选择此项，将创建一个根文件夹，需要输入根文件夹名，可以设置同步状态和根文件夹显示图标。
图 创建新根文件夹
如果选中“同步文件夹”即可保持文件夹与网络同步。不选则为离线文件夹。
选择此项，将弹出文件夹的属性对话框。
若为普通文件夹，则显示如下对话框：
图 普通文件夹属性
若为根文件夹，则显示如下对话框：
图 根文件夹属性
除设置“同步文件夹”和显示图标外，其他功能相同
这里可以进行改名操作
也可以进行更改显示模版操作，显示模版详细请见WizExplorer文档模版
按钮功能：
打开：打开预览当前显示模版效果；
更改...：打开显示模版窗口，选择其他模版；
删除：删除此目录下的显示模版设定。
设置显示模板后，此目录下的正文内容，将会自动套用模版显示。
在“已删除”文件夹上点击右键，出现下图菜单
图 “已删除”文件夹右键菜单
将已删除到回收站中的文档彻底删除，此操作不可恢复，将会彻底删除文件。